Molecola del Mese
di David S. Goodsell
trad di Mauro Tonellato

Canali del sodio
controllati dal voltaggio


Molecola del mese di marzo 2020
I canali del sodio controllati dal voltaggio trasmettono il segnale nervoso come un'onda elettrica lungo il nervo.

Introduzione
Proprio adesso mentre sto scrivendo questo articolo, una cascata di segnali sta scorrendo nel mio sistema nervoso e mi aiuta a decidere come iniziare il discorso. La stessa cosa sta accadendo nel vostro cervello mentre leggete queste parole e ne cogliete il significato. Gli impulsi nervosi viaggiano nel sistema nervoso a grande velocità portando messaggi da un neurone all'altro e tutti insieme costruiscono il nostro pensiero e controllano le nostre azioni. La trasmissione di ogni messaggio avviene con due modalità diverse. Un sistema complesso di neurotrasmettitori e di recettori, come i recettori AMPA del glutammato (mdm 7-2019), trasmettono i segnali attraverso le sinapsi da un neurone al successivo.
Un sistema più semplice, formato dai canali del sodio controllati dal voltaggio e da poche altre molecole, trasmette il segnale lungo gli assoni, la parte allungata dei neuroni.

Onda di segnalazione
Le membrane degli assoni sono piene di canali che si aprono e si chiudono in base alla differenza di voltaggio tra l'interno e l'esterno della membrana. Se la differenza di voltaggio è alta, questi canali sono chiusi, ma quando la differenza di voltaggio scende si aprono per un breve istante e lasciano passare ioni sodio attraverso la membrana. Per mandare il segnale nervoso sono necessari pochi e semplici passaggi. Primo, le pompe ioniche devono creare un eccesso di ioni sodio all'esterno della cellula creando la differenza di voltaggio che tiene chiusi i canali. Il segnale è innescato da altri canali che permettono al sodio di tornare all'interno della membrana uguagliando la concentrazione di sodio da entrambi i lati. Questo processo riduce la differenza di voltaggio localmente e fa aprire i canali del sodio vicini. Il voltaggio si riduce anche attorno a questi canali e così altri canali si aprono più a valle lungo l'assone. Come la ola in uno stadio di calcio, quest'onda di apertura di canali si propaga lungo l'assone fino al suo termine dove si affaccia con una sinapsi al neurone successivo. Naturalmente, come accade spesso in biologia, le cose non sono mai così semplici e intervengono canali del potassio e altre proteine per modulare l'onda con precisione.

Sentire il voltaggio
I nostri canali del sodio controllati dal voltaggio, come quello mostrato qui (file PDB 6j8j) sono costituiti da una lunga catena proteica ripiegata su sé stessa per formare un poro attraverso la membrana, con quattro elementi sensibili al voltaggio disposti attorno al poro. Alcune altre subunità, mostrate in verde, modulano l'azione del canale. Gli elementi sensibili al voltaggio contengono un segmento ad alfa elica nel quale vi sono molte arginine e lisine, amminoacidi carichi positivamente (mostrati in magenta) che rispondono ai cambiamenti nel voltaggio locale aprendo e chiudendo il poro.

Tossine terribili
I canali del sodio trasmettono, lungo i nervi, tutti i messaggi tra il cervello e i muscoli e quindi è facile immaginare che siano dei bersagli molto sensibili se vengono attaccati. Molti animali sintetizzano piccole tossine che bloccano l'azione di questi canali e provocano la paralisi.
Due di queste sono legate al canale del sodio mostrato qui a fianco (file PDB 6a95).
La tetrodotossina (evidenziata in verde) è la tossina mortale dei pesci palla e di altre varietà di animali velenosi, si lega nel centro del canale e chiude fisicamente il poro.
La tossina del ragno (evidenziata in giallo) si lega, invece, agli elementi sensibili al voltaggio e ne disturba l'azione e così consente al ragno di paralizzare la sua preda.
Queste tossine non sono tutte terribili, alcune di queste ci hanno insegnato come modificare la funzione dei canali del sodio per fermare il dolore o per curare alcune malattie nervose.















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Nell'immagine qui sopra, realizzata con Chimera, si vede la tossina di pesce palla, tetrodotossina, mostrata con sfere al centro, che blocca il canale. Si vede uno ione sodio verde fermo nel canale sotto la tossina.
La tossina di ragno gialla, invece, è legata al sensore del voltaggio sulla sinistra ricco di arginine (magenta) e ne altera la funzionalità


Nell'immagine qui a destra si vede la tetrodotossina in primo piano all'interno del canale. Subito sopra vi è uno ione sodio verde, complessato da alcuni amminoacidi di acido aspartico e glutammico, che non può proseguire la sua corsa nel canale.































Esplorando la struttura
I ricercatori sono riusciti a catturare sia la forma aperta che quella chiusa del canale del sodio controllato dal voltaggio, usando la struttura molto semplice di un canale batterico. Questo canale è composto di quattro subunità identiche che, insieme, formano una struttura simile a quella delle nostre cellule che è composta da una singola catena molto lunga. Queste strutture mostrano che gli elementi sensibili al voltaggio si muovono, quando il voltaggio scende, e trascinano un segmento connesso al poro centrale (file PDB 5vb8, 6p6w).


















Spunti per ulteriori esplorazioni
Negli archivi PDB sono disponibili le strutture di molte altre tossine di ragni, scorpioni e altre creature velenose, comprese molte tossine legate ai canali del sodio controllati dal voltaggio.
Vi sono anche strutture di canali per altri ioni controllati dal voltaggio. In cosa assomigliano a quelli per il sodio e in cosa si differenziano?

Bibliografia
6j8j: Shen, H., Liu, D., Wu, K., Lei, J., Yan, N. (2019) Structures of human Nav1.7 channel in complex with auxiliary subunits and animal toxins. Science 363: 1303-1308
6p6w: Wisedchaisri, G., Tonggu, L., McCord, E., Gamal El-Din, T.M., Wang, L., Zheng, N., Catterall, W.A. (2019) Resting-State Structure and Gating Mechanism of a Voltage-Gated Sodium Channel. Cell 178: 993-1003
Xu, L., Ding, X., Wang, T., Mou, S., Sun, H., Hou, T. (2019) Voltage-gated sodium channels: structures, functions, and molecular modeling. Drug Discov. Today 24, 1389-1397
6a95: Shen, H., Li, Z., Jiang, Y., Pan, X., Wu, J., Cristofori-Armstrong, B., Smith, J.J., Chin, Y.K.Y., Lei, J., Zhou, Q., King, G.F., Yan, N. (2018) Structural basis for the modulation of voltage-gated sodium channels by animal toxins. Science 362: eaau2596
5vb8: Lenaeus, M.J., Gamal El-Din, T.M., Ing, C., Ramanadane, K., Pomes, R., Zheng, N., Catterall, W.A. (2017) Structures of closed and open states of a voltage-gated sodium channel. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 114: E3051-E3060

 

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