Pianeta
Chimica.it
Responsabile:
Prof. Mauro Tonellato
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MODELLISTICA MOLECOLARE
CON ArgusLab
11^ LEZIONE
PONTE CLORONIO
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Lezioni con
ArgusLab
1-butene
e 2-butene
Carbocatione
1° e 2°
Acetone
e tautomeria
Dieni
coniugati (pdf)
Benzene
e aromaticità (pdf)
Legame covalente
Conformazione alcani
Ponte Cloronio
Diels-Alder
Enolo
Mono e Disostituito (pdf)
Lezioni con
MGL Tools / AutoDock
Struttura delle Proteine
Proteine e Legandi
Docking su COX2
Progettare
nuovi farmaci
PianetaChimica home
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Per seguire questa lezione dovete avere già visto la 1^ e la
2^ lezione di modellistica molecolare con ArgusLab nelle quali sono
state spiegate le procedure di base che qui verranno date per conosciute.
Arguslab 4.01 può essere scaricato gratuitamente qui:
http://www.arguslab.com
Questa lezione può essere affrontata in due modi:
1) Online. Potete leggere le istruzioni ed eseguirle passo passo
al computer con ArgusLab, aiutandovi con le illustrazioni che chiariscono
ogni passaggio.
2) In aula informatica con la classe. Se siete insegnanti di
chimica, potete adattare la lezione alle esigenze della vostra classe
e proporla in aula informatica ai vostri allievi.
La durata della lezione è di circa due ore.
N.B. Cliccando sulle immagini potrete vederle a pieno schermo.
Gli argomenti di questa lezione sono:
-- Addizione elettrofila di cloro agli alcheni
-- Formazione del ponte cloronio
-- Discussione sulla reattività del ponte cloronio utilizzando
gli orbitali LUMO
-- Calcolo dell'energia dell'intermedio a ponte cloronio e confronto
con il carbocatione aperto
-- Ponte cloronio asimmetrico e orientazione secondo Markovnikov
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Addizione di cloro agli alcheni
Nell'alogenazione degli alcheni, il cloro Cl2
si somma al doppio legame con una addizione elettrofila anti,
cioè i due atomi di cloro si legano ai due carboni del doppio
legame da lati opposti rispetto al piano dell'alchene.
Il meccanismo proposto per spiegare questo strano comportamento
della reazione prevede la formazione di un catione intermedio
nel quale l'atomo di cloro si lega ad entrambi i carboni del doppio
legame formando uno strano anello a tre atomi chiamato ponte cloronio.
In questo intermedio la carica positiva che dovrebbe essere sul carbonio,
è stabilizzata dagli elettroni di non legame del cloro che assume
una parte della carica positiva su di sè. Anche se l'anello a
tre atomi formato è in tensione angolare, permette a tutti gli
atomi di raggiungere l'ottetto elettronico e questo rende più
stabile il ponte cloronio rispetto ad un carbocatione aperto.
L'atomo di cloro legato a ponte impedisce l'attacco
del secondo cloro da questo lato della molecola e obbliga quindi il
Cl- ad attaccare
il carbocatione dalla parte opposta rispetto al piano dell'alchene.
La struttura dell'intermedio a ponte cloronio è
stata introdotta per spiegare l'andamento della reazione che procede
con addizione anti coplanare, ma è possibile vedere il ponte
cloronio?
- è possibile produrre il ponte cloronio con un programma
di simulazione molecolare come ArgusLab?
- la sua energia è davvero minore di quella del carbocatione
a struttura aperta?
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fig. 1
fig. 2
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Creare il cis-2-butene
Per iniziare, costruite con ArguLab la molecola
cis-2-butene.
Legate insieme i quattro carboni della catena. (C sp3
- Shift + Click destro)
Impostate i due carboni centrali con una struttura sp2
planare. (Click destro - Change Atom)
Aggiungete infine gli idrogeni (pulsante H).
Otterrete così la struttura grezza del cis-2-butene mostrata
in figura 1.
Ottimizzate la molecola col metodo UFF e poi col metodo PM3, otterrete
la molecola di figura 2.
(Calculation - Optimize Geometry - ...)
A questo punto siete pronti per trasformare il cis-2-butene nel carbocatione
intermedio della reazione di alogenazione.
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fig. 3
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Creare il carbocatione intermedio
Trasformate uno dei due carboni del doppio legame in un carbonio tetraedrico
sp3
(Click destro - Change Atom)
Legate un atomo di cloro a questo carbonio.
(Cloro - Shift + Click destro)
Otterrete la molecola di figura 3.
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fig. 4
fig. 5
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Formare il ponte cloronio
Prima di ottimizzare la molecola ricordate
di impostare la carica della molecola a +1.
(Calculation - Optimize Geometry - Net Charge 1)
Ottimizzate ora la molecola col metodo UFF e poi col metodo PM3. Vedrete
l'atomo di cloro piegarsi lentamente verso il carbonio per formare il
ponte cloronio. (figura 4).
Se i calcoli non convergono verso un minimo di energia al primo tentativo,
ripeteteli più volte premendo il pulsante bunsen
fino ad ottenere la convergenza.
Calcolate l'energia della molecola (Calculation - Energy - PM3 - Start).
Dovreste ottenere un'entalpia di formazione di circa DH
= 195,9102 kcal/mol.
Per mettere meglio in evidenza il ponte cloronio, create
il secondo legame carbonio-cloro. Cliccate sul carbonio (diventa giallo)
poi fate Shift+Click sul cloro e otterrete una molecola con il ponte
cloronio perfettamente disegnato. (figura 5).
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fig. 6 a
fig 6 b
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Orbitale LUMO e attacco anti
Cliccate ora sul pulsante con i due lobi blu e rosso
(QuickPlot
Lowest Unoccupied MO Surface) per rappresentare in modo veloce l'orbitale
LUMO (Lowest Unoccupied Molecular Orbital)
Si tratta del primo orbitale di antilegame cioè l'orbitale vuoto
di minore energia, l'orbitale nel quale giungono gli elettroni di un nucleofilo
(in questo caso del Cl-)
che attacca la molecola.
La struttura dell'orbitale LUMO è importante perchè ci fa
capire come avviene l'attacco nucleofilo al ponte cloronio.
L'orbitale LUMO è illustrato in figura 6a (rappresentato con l'opzione
Mesh) e in figura 6b.
Osservate che è un orbitale di antilegame (ha un nodo tra cloro
e carboni). E' costituito dalla sovrapposizione dell'orbitale 3p del cloro
con i due orbitali 2p p
dei due carboni centrali. Questo orbitale può essere attaccato
dal Cl- solo dalla
parte sotto la molecola sul lobo blu non ingombrato, dalla parte opposta
a quella occupata dal primo cloro (verde) che costituisce il ponte cloronio,
producendo così l'attacco anti.
Notate che l'orbitale è perfettamente distribuito sui due carboni
centrali, quindi l'attacco del Cl-
può avvenire indifferentemente sul carbonio
2 oppure sul carbonio 3 della molecola.
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fig. 7
fig. 8
fig. 9
fig. 10
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Formare il carbocatione a struttura aperta
Fate click destro sull'orbitale LUMO e scegliete Hide Surface.
Cliccate sul legame C - Cl del ponte cloronio costruito prima e cancellatelo
con Canc.
Cliccate ora sul legame centrale e preparatevi a ruotarlo. (figura
7)
Ruotate manualmente la molecola attorno al legame centrale carbonio-carbonio
fino a portare il metile in alto come in figura 8.
(cliccate sul legame - poi premete Alt + Shift e trascinate
il mouse col pulsante sinistro premuto fino ad ottenere un angolo di circa
105°)
Ruotate manualmente anche il CH3 terminale
per evitare l'ingombro sterico tra idrogeno e cloro fino ad ottenere la
conformazione di figura 9.
Ottimizzate ora la molecola col metodo PM3. Otterrete la struttura di
figura 10
Si è formato un carbocatione a struttura aperta invece del
ponte cloronio. Questo dipende dal fatto che l'energia della molecola
non ha un solo minimo, ma ha vari minimi relativi
oltre ad un minimo assoluto.
Se la molecola giunge ad un minimo relativo, ArgusLab
si ferma e fornisce quel risultato.
Per ottenere una particolare conformazione della molecola, bisogna quindi
ruotare manualmente i legami per avvicinare la struttura a quella desiderata.
ArgusLab poi calcola la struttura stabile più vicina a quella impostata.
E' per questo che per ottimizzare la geometria di una molecola si usa
prima il metodo UFF (geometrico) per creare una struttura sensata in base
a sole considerazioni geometriche e poi il metodo PM3 quantomeccanico
parametrico.
Calcolate ora l'energia del carbocatione a
struttura aperta (Calculation - Energy - PM3 - Start)
Dovreste ottenere un'entalpia di formazione di circa DH
= 199,5955 kcal/mol.
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Confronto tra le stabilità dei due intermedi
Le entalpie di formazione calcolate da ArgusLab sono state:
per il ponte cloronio DH
= 195,9102 kcal/mol.
per il carbocatione a struttura aperta DH
= 199,5955 kcal/mol.
L'intermedio a ponte cloronio risulta quindi più stabile di circa
3,68 kcal/mol rispetto al carbocatione a struttura aperta. Questo significa
che la sua formazione è grandemente favorita.
Applicando l'equazione
DG° = -
RT lnK
e approssimando DG°
con DH° si
ottiene
lnK = - DG°
/ RT
lnK = 3,68. 4184
/ 8,314 298
lnK = 6,22
K = 504,5
La formazione del ponte cloronio dovrebbe
essere circa 500
volte più abbondante rispetto a quella del carbocatione a struttura
aperta.
ArgusLab, però, calcola le energie delle molecole in fase
vapore, quindi tutto questo ragionamento vale solo se il solvente
non interviene stabilizzando il carbocatione.
In solvente acquoso, infatti, non si forma il ponte cloronio,
ma si forma piuttosto il carbocatione a struttura aperta, stabilizzato
dall'acqua e quindi la reazione non procede con addizione anticoplanare,
ma con addizione casuale.
In solvente apolare, invece, (CCl4
o CH2Cl2)
, si forma regolarmente il ponte cloronio che è molto
più stabile del carbocatione aperto, e l'addizione è anticoplanare.
Per la formazione del ponte cloronio sono tollerate piccole quantità
di acqua come nella sintesi delle aloidrine nella quale un alchene
viene fatto reagire con cloro e acqua per formare una cloridrina con
addizione anticoplanare.
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Aloidrine secondo Markovnikov
Il ponte cloronio studiato qui sopra era simmetrico e il suo orbitale
LUMO era perfettamente distribuito sui due carboni del ponte, quindi il
Cl- poteva attaccare
indifferentemente uno o l'altro dei due carboni.
Cosa accade, invece, se l'alchene di partenza non è simmetrico
come, per esempio, nel caso del 1-propene?
La reazione ideale per esplorare questa situazione è la sintesi
delle aloidrine.
L'1-propene reagisce con cloro e acqua per formare 1-cloro-2-propanolo.
La reazione inizia con il doppio legame del propene che attacca il Cl2
e si lega al Cl+ per formare il ponte cloronio.
Il secondo attacco, però, non è portato dal Cl- (poco nucleofilo
se solvatato in acqua), ma dall'acqua che attacca il ponte cloronio dalla
parte opposta rispetto a quella occupata dal cloro (attacco anti),
e inoltre si lega sempre sul carbonio più sostituito (secondo
Markovnikov).
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fig. 11
fig. 12
fig. 13
fig. 14
fig. 15 a
fig. 15 b
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Ponte cloronio asimmetrico
E' interessante osservare l'orbitale LUMO dell'intermedio a ponte
cloronio asimmetrico del 1-propene per comprendere perchè l'acqua
sia portata ad attaccare il carbonio più sostituito.
Create con ArgusLab la molecola di 1-propene e ottimizzate la sua geometria
col metodo UFF e poi con PM3. (figura 11)
Trasformate il carbonio 1 che ha ibridazione sp2
in carbonio sp3,
e legategli un atomo di cloro (figura 12).
Ottimizzate la geometria, dopo aver impostato la carica a +1, col metodo
UFF e poi con PM3. Dovreste ottenere il ponte cloronio come in figura
13.
Create il secondo legame carbonio-cloro (figura 14)
Cliccate sul pulsante con i due lobi blu e rosso
(QuickPlot Lowest Unoccupied MO Surface) per rappresentare in modo veloce
l'orbitale LUMO (figure 15a e 15b).
Questo è l'orbitale LUMO, cioè il primo degli orbitali
vuoti di antilegame, quello sul quale arrivano gli elettroni dell'attacco
nucleofilo dell'acqua. Questo orbitale è costituito dall'orbitale
2p p del carbonio
centrale C2 (il carbonio più sostituito), stabilizzato dall'orbitale
3p del cloro e dalla sovrapposizione con l'orbitale sp3
che lega l'idrogeno sul CH3
sostituente. Gran parte della carica positiva dell'intermedio, quindi,
si trova sul carbonio C2 (oltre che sul cloro). L'acqua che attacca
l'intermedio attacca il C2 sul lobo non ingombrato dell'orbitale (il
lobo blu) che si trova dalla parte opposta a quella occupata dal cloro.
Appare evidente, osservando la figura 15, che l'attacco deve essere
anti (sul lobo blu) e che deve seguire la regola di Markovnikov
(attacco sul C2).
Autore: prof
Mauro Tonellato
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Chimica
al Computer
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